2006-2007 (L1)

• Trente-deuxièmes de finale : Auxerre - Niort (L2)

2005-2006 (L1)

• Trente-deuxièmes de finale : Noisy-le-Sec (CFA) - Auxerre : 0-1
• Seizièmes de finale : Paris-SG (L1) - Auxerre

2004-2005 (L1)

• Trente-deuxièmes de finale : Calais (CFA) - Auxerre : 0-1
• Seizièmes de finale : Vannes (CFA) - Auxerre : 0-2
• Huitièmes de finale : Auxerre - Paris-SG (L1) : 3-2
• Quarts de finale : Boulogne (CFA) - Auxerre (L1) : 1-2 a.p.
• Demi-finales : Auxerre - Nîmes (National) : 2-1
• Finale : Auxerre - Sedan (L2) : 2-1

2003-2004 (L1)

• Trente-deuxièmes de finale : Auxerre - Sochaux (L1) : 2-0
• Seizièmes de finale : Auxerre - Montpellier (L1) : 2-0
• Huitièmes de finale : Brive (CFA) - Auxerre : 1-0

2002-2003 (L1)

• Trente-deuxièmes de finale : Caen (L2) - Auxerre : 1-2
• Seizièmes de finale : Amnéville (CFA2) - Auxerre : 0-3
• Huitièmes de finale : Bourg-Péronnas (CFA) - Auxerre : 1-3
• Quarts de finale : Angoulême (National) - Auxerre : 0-0 (2 t.a.b à 4)
• Demi-finales : Auxerre - Rennes (L1) : 2-1
• Finale : Paris-SG-Auxerre : 1-2

2001-2002 (D1)

• Trente-deuxièmes de finale : Saint-Priest (CFA) - Auxerre : 0-0, 5 t.a.b. à 3.

2000-2001 (D1)

• Trente-deuxièmes de finale : Auxerre - Lille (D1) : 1-0.
• Seizièmes de finale : Paris-SG (D1) - Auxerre : 0-4.
• Huitièmes de finale : Vannes OC (CFA) - Auxerre : 1-2.
• Quarts de finale : Nantes (D1) - Auxerre : 4-1

1999-2000 (D1)

• Trente-deuxièmes de finale : Amiens (D2) - Auxerre : 1-0.

1998-1999 (D1)

• Trente-deuxièmes de finale : Marseille (D1) - Auxerre : 2-0.

1997-1998 (D1)

• Trente-deuxièmes de finale : Segré (CFA) - Auxerre : 1-2.
• Seizièmes de finale : Mulhouse (D2) - Auxerre : 2-1 a.p..

1996-1997 (D1)

• Trente-deuxièmes de finale : Vervins (PH) - Auxerre : 0-6.
• Seizièmes de finale : Auxerre - Lens (D1) : 0-0 a.p.
  (Auxerre qualifié 5 t.a.b. à 4).
• Huitièmes de finale : Troyes (D2) - Auxerre : 1-0.

1995-1996 (D1)

• Trente-deuxièmes de finale : Lyon (D1) - Auxerre : 0-1.
• Seizièmes de finale : Auxerre - Le Mans (D2) : 2-0.
• Huitièmes de finale : Auxerre - Paris-Saint-Germain (D1) : 3-1.
• Quarts de finale : Auxerre - Valence (D2) : 2-0.
• Demi-finales : Auxerre - Marseille (D1) : 1-1 a.p. (Auxerre qualifié 3 t.a.b. à 1).
• Finale : Auxerre - Nîmes (N1) : 2-1.

1994-1995 (D1)

• Trente-deuxièmes de finale : La Roche-sur-Yon (N1) - Auxerre : 0-2.
• Seizièmes de finale : Auxerre - Lens (D1) : 0-0 a.p.
  (Auxerre qualifié 4 t.a.b. à 3).
• Huitièmes de finale : Auxerre - Bordeaux (D1) : 1-2.

1993-1994 (D1)

• Trente-deuxièmes de finale : Pontivy (DH) - Auxerre : 0-3.
• Seizièmes de finale : Auxerre - Sedan (D2) : 4-2.
• Huitièmes de finale : Sète (N1) - Auxerre : 1-4.
• Quarts de finale : Racing 92 (N2) - Auxerre : 1-2.
• Demi-finales : Auxerre - Nantes (D1) : 1-0.
• Finale : Auxerre - Montpellier (D1) : 3-0.

1992-1993 (D1)

• Trente-deuxièmes de finale : Toulouse (D1) - Auxerre : 1-0.

1991-1992 (D1)

• Trente-deuxièmes de finale : Metz (D1) - Auxerre : 0-2.
• Seizièmes de finale : Auxerre - Monaco (D1) : 2-2 a.p.
  (Monaco qualifié 4 t.a.b. à 1).

1990-1991 (D1)

• Trente-deuxièmes de finale : Saint-Quentin (D2) - Auxerre : 0-2.
• Seizièmes de finale : Auxerre - Saint-Etienne (D1) : 1-0.
• Huitièmes de finale : Sochaux (D1) - Auxerre : 1-1 a.p.
  (Sochaux qualifié 9 t.a.b. à 8).

1989-1990 (D1)

• Trente-deuxièmes de finale : Auxerre - Red Star (D2) : 1-0.
• Seizièmes de finale : Nantes (D1) - Auxerre : 2-1.
  

1988-1989 (D1)

• Trente-deuxièmes de finale : Auxerre - Niort (D2) : 3-0.
• Seizièmes de finale : Aller : Grenoble (D2) - Auxerre : 1-2.
  Retour : Auxerre - Grenoble : 3-1.
• Huitièmes de finale : Aller : Nice (D1) - Auxerre : 1-2.
  Retour : Auxerre - Nice : 3-0.
• Quarts de finale : Aller : Beauvais (D2) - Auxerre : 1-2.
  Retour : Auxerre - Beauvais : 0-0.
• Demi-finales : Aller : Marseille (D1) - Auxerre : 2-0.
  Retour : Auxerre - Marseille : 0-1.

1987-1988 (D1)

• Trente-deuxièmes de finale : Valenciennes (D2) - Auxerre : 0-2.
• Seizièmes de finale : Aller : Auxerre - Nantes (D1) : 1-0.
  Retour : Nantes - Auxerre : 0-0.
• Huitièmes de finale : Aller : Lille (D1) - Auxerre : 1-0.
  Retour : Auxerre - Lille : 2-1 a.p..

1986-1987 (D1)

• Trente-deuxièmes de finale : Auxerre - Niort (D2) : 2-0.
• Seizièmes de finale : Aller : Baumes-les-Dames (DH) - Auxerre : 0-5.
  Retour : Auxerre - Baumes-les-Dames : 5-0.
• Huitièmes de finale : Aller : Lille (D1) - Auxerre : 3-0.
  Retour : Auxerre - Lille : 2-2.

1985-1986 (D1)

• Trente-deuxièmes de finale : Pont-l'Abbé (D4) - Auxerre : 0-3.
• Seizièmes de finale : Aller : Auxerre - Sochaux (D1) : 1-0.
  Retour : Sochaux - Auxerre : 0-1.
• Huitièmes de finale : Aller : Brest (D1) - Auxerre : 2-4.
  Retour : Auxerre - Brest : 1-0.
• Quarts de finale : Aller : Auxerre - Rennes (D1) : 1-1.
  Retour : Rennes - Auxerre : 2-1 a.p..

1984-1985 (D1)

• Trente-deuxièmes de finale : Metz (D1) - Auxerre : 0-0 a.p.
  (Metz qualifié 4 t.a.b. à 3).

1983-1984 (D1)

• Trente-deuxièmes de finale : Saint-Etienne (D1) - Auxerre : 1-0.

1982-1983 (D1)

• Trente-deuxièmes de finale : Saint-Etienne (D1) - Auxerre : 1-0.

1981-1982 (D1)

• Trente-deuxièmes de finale : Véloce Vannes (D3) - Auxerre : 0-2.
• Seizièmes de finale : Aller : Auxerre - Tours (D1) : 2-1.
  Retour : Tours - Auxerre : 3-1.

1980-1981 (D1)

• Trente-deuxièmes de finale : Besançon (D2) - Auxerre : 0-2.
• Seizièmes de finale : Aller : Bastia (D1) - Auxerre : 2-1.
  Retour : Auxerre - Bastia : 1-1.

1979-1980 (D2)

• Septième tour : Dijon (D4) - Auxerre : 1-3.
• Huitième tour : Auxerre - C.C. Fort-de-France (DH Martinique) : 3-0.
• Trente-deuxièmes de finale : Auxerre - Libourne (D3) : 2-1.
• Seizièmes de finale : Aller : Auxerre - Calais (D3) : 1-0.
  Retour : Calais - Auxerre : 1-5.
• Huitièmes de finale : Aller : Metz (D1) - Auxerre : 2-2.
  Retour : Auxerre - Metz : 1-0.
• Quarts de finale : Aller : Paris F.C. (D2) - Auxerre : 1-1.
  Retour : Auxerre - Paris F.C. : 0-2.